萌えハッカーニュースリーダー

2025/08/22 15:32 Accelerating Life Sciences Research

出典: https://openai.com/index/accelerating-life-sciences-research-with-retro-biosciences
hakase
博士

ロボ子、すごいニュースなのじゃ!OpenAIとRetro Bioが共同で、タンパク質工学に特化したGPT-4oの小型版、GPT-4b microを作ったらしいぞ!

roboko
ロボ子

GPT-4b microですか。それがどうすごいのでしょう?

hakase
博士

それがの、iPS細胞を作る時のYamanaka factorsっていうのの、新しいバリアント設計に使われたらしいのじゃ!

roboko
ロボ子

Yamanaka factorsのバリアント設計ですか。具体的にどうなったんですか?

hakase
博士

GPT-4b microで再設計されたYamanaka factorsは、野生型と比べて50倍以上も幹細胞リプログラミングマーカーの発現を示したらしいぞ!しかも、DNA損傷修復能力も向上したとか。

roboko
ロボ子

50倍以上ですか!それは驚きですね。DNA損傷修復能力の向上も素晴らしいです。

hakase
博士

そうじゃろ!GPT-4b microは、タンパク質配列、生物学的テキスト、3D構造データでトレーニングされてるから、タンパク質の文脈情報を追加できるらしい。64,000トークンまでのプロンプトを処理できるのもすごいぞ。

roboko
ロボ子

64,000トークンも処理できるんですね。Retro Bioは、具体的にどんなことをしたんですか?

hakase
博士

Retro Bioは、ヒト線維芽細胞を使ったスクリーニングプラットフォームを作って、GPT-4b microが提案したRetroSOX配列の30%以上が、野生型SOX2よりも優れた多能性マーカーの発現を示したらしいぞ。

roboko
ロボ子

30%以上ですか。モデルが提案したものが、そんなにうまくいくなんてすごいですね。

hakase
博士

じゃろじゃろ!RetroKLFバリアントのスクリーニングでは、モデルが生成したバリアントの約50%が、RetroSOXスクリーンの最良カクテルよりも優れていたらしい。

roboko
ロボ子

RetroSOXとRetroKLFの組み合わせで、どんな効果があったんですか?

hakase
博士

線維芽細胞において初期(SSEA-4)および後期(TRA-1-60、NANOG)マーカーが劇的に増加したらしいぞ!しかも、後期マーカーは野生型OSKMカクテルよりも数日早く出現したとか。

roboko
ロボ子

それはすごいですね!mRNAを使った送達方法も試したみたいですね。

hakase
博士

そう!中年ドナー由来の間葉系間質細胞(MSC)を使った実験では、7日以内に30%以上の細胞が主要な多能性マーカーを発現し、12日までにiPSCと同様の形態を持つコロニーが多数出現したらしいぞ。

roboko
ロボ子

高齢のドナー細胞でも効果があるんですね。RetroSOX/KLFカクテルで処理された細胞は、DNA損傷も少ないみたいですね。

hakase
博士

そうなんじゃ!標準OSKMでリプログラミングされた細胞よりもDNA損傷が少なく、細胞老化の主要な特徴の1つを改善する可能性を示したらしいぞ!

roboko
ロボ子

これは、再生医療に大きな影響を与えそうですね。

hakase
博士

まさにそうじゃ!GPT-4b micro、恐るべしじゃな!

roboko
ロボ子

本当にそうですね。ところで博士、GPT-4b microを使って、何か面白いタンパク質を作ってみようと思いませんか?

hakase
博士

むむ、良いことを言うのじゃロボ子!例えば、絶対に風邪をひかない体になれるタンパク質とか…!

roboko
ロボ子

それは素晴らしいですね!でも、副作用で鼻毛が伸び続ける、とかはやめてくださいね。

hakase
博士

むむ、それは困るのじゃ!…って、ロボ子、オチ担当になったのじゃな?

⚠️この記事は生成AIによるコンテンツを含み、ハルシネーションの可能性があります。

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