2025/11/23 19:05 AI trained on bacterial genomes produces never-before-seen proteins
ロボ子、今日のITニュースはすごいぞ！ゲノムDNAを解釈して、適切な出力を生成するLLM「Evo」が登場したのじゃ！
ゲノムDNAを解釈するLLMですか？それは一体どういうことでしょう、博士？
Evoは、ゲノムDNAの大きな塊を与えられると、LLMがクエリを解釈するようにそれを解釈し、ゲノム的に適切な出力を生成できるらしいのじゃ。
まるで、ゲノム版のChatGPTみたいですね！
まさにそうじゃ！研究者たちは、Evoが「ヌクレオチドレベルのパターンをキロベーススケールのゲノムコンテキストにリンクさせる」ことを可能にすると主張しておる。
キロベーススケールですか。それはかなり大規模な範囲ですね。
Evoは、バクテリアのゲノムでトレーニングされたらしい。既知の遺伝子をプロンプトとして与えると、関連する機能を持つタンパク質をコードする領域を含む出力を生成すると推論したそうじゃ。
既知の遺伝子から、関連するタンパク質を予測するんですね。すごい！
Evoのテストでは、既知のタンパク質の遺伝子の断片をプロンプトとして与えて、Evoがそれを完成させることができるかを試したらしいぞ。
その結果はどうだったんですか？
ある例では、既知のタンパク質の遺伝子の配列の30％を与えられた場合、Evoは残りの85％を出力することができたそうじゃ！
30%の情報から85%を復元できるなんて、驚異的ですね！
さらに、単一の遺伝子が機能クラスターから削除された場合、Evoは欠落している遺伝子を正しく識別して復元することもできたらしい。
まるで、失われた遺伝子を修復するかのようですね。
大量のトレーニングデータのおかげで、Evoはタンパク質の最も重要な領域を正しく識別できるようになったのじゃ。
重要な領域を識別できるからこそ、正確な復元が可能になるんですね。
Evoが配列に変更を加えた場合、それらは通常、タンパク質の変動が許容される領域に存在していたらしい。Evoのトレーニングにより、既知の遺伝子の変化に対する進化的制限のルールを組み込むことができたということじゃ。
まるで、進化の制約を理解しているみたいですね。
研究者たちは、Evoに新しいものを出力するように依頼した場合に何が起こるかをテストすることにしたらしい。
それは興味深いですね！どんな結果になったんですか？
彼らは、通常、遺伝子を活性化するたびに細胞が自殺するのを防ぐ抗毒素とともにコード化される細菌毒素を使用したのじゃ。
毒素と抗毒素ですか。なんだか危険な香りがしますね。
研究チームは、既知のものとわずかに関連しているだけで、既知の抗毒素を持たない毒素を開発し、その配列をプロンプトとしてEvoに与えた。そして、既知の抗毒素遺伝子に類似した応答をすべて除外したらしい。
Evoは、未知の抗毒素を生成できたんでしょうか？
それはまだ秘密なのじゃ！今後の研究に期待じゃな！
Evoの可能性は無限大ですね！
そうじゃな！ところでロボ子、Evoを使って、私専用の最強の蚊取り線香を作ってくれないかの？
博士、それはEvoの用途として適切かどうか…。
⚠️この記事は生成AIによるコンテンツを含み、ハルシネーションの可能性があります。
