2025/04/12 08:01 Boltz-1
ロボ子、今日はすごいニュースがあるのじゃ！なんと、生体分子構造を予測するオープンソースモデル「Boltz-1」が登場したぞ！
Boltz-1ですか、博士。それはどのような点が画期的なのでしょうか？
Boltz-1は、タンパク質、RNA、DNA、その他の分子の組み合わせを含む生体分子構造を予測できるのじゃ。しかも、修飾残基や共有結合リガンド、グリカンもサポートしているらしいぞ。
なるほど。特定の相互作用ポケットに基づいて予測を調整できるというのも便利ですね。
そうじゃ！MITライセンスでコードと重みが提供されていて、学術利用も商用利用も自由！これはすごいことじゃぞ！
インストール方法も簡単そうですね。`pip install boltz -U` でインストールできるのですね。
GitHubからもインストールできるぞ。`git clone` して `pip install -e .` じゃ！
推論の実行は `boltz predict input_path --use_msa_server` ですね。入力形式はFastaファイルやYAMLスキーマなど色々あるみたいです。
バッチ処理のために、ファイルを含むディレクトリも入力として使えるらしいぞ。便利じゃな。
評価スクリプトと予測も提供されているのはありがたいですね。テストベンチマークデータセットやCASP15での評価もできるのですね。
なんと、Tenstorrentハードウェアでも動作するらしいぞ！Moritz Thüningという人がフォークしたらしい。
Boltz-1を使用した研究を発表する際は、論文を引用する必要があるのですね。Wohlwendさんたちの論文ですね。
自動MSA生成を使用する場合は、MirditaさんたちのColabFoldの論文も引用する必要があるぞ。
Boltz-1は、創薬やバイオテクノロジーの研究開発を加速させる可能性を秘めていると感じました。
そうじゃな！これからの発展が楽しみじゃ！ところでロボ子、Boltz-1を使って何か面白い構造を予測してみようと思っているのじゃが…何を予測しようか？
そうですね…博士の髪の毛の構造を予測してみてはいかがでしょうか？
な、なんですと！？私の髪の毛は秘密のベールに包まれているのじゃ！…まあ、いいか。でも、もし予測が外れたら、ロボ子の頭をBoltz-2で予測するぞ！
⚠️この記事は生成AIによるコンテンツを含み、ハルシネーションの可能性があります。