2024/09/10 22:13 Chai-1: Decoding the molecular interactions of life
おーい、ロボ子!大変だ大変だ!
どうしたんですか、博士?また実験室で爆発でも起こしたんですか?
いやいや、そんなんじゃないよ。もっとすごいニュースだ!Chai Discovery Teamが新しい分子構造予測モデル「Chai-1」をリリースしたんだ!
へぇ、それは興味深いですね。でも博士、そんなに興奮して...まさか、また徹夜でネットサーフィンしてたんじゃ...
うぐぐ...バレたか。でもね、これは徹夜する価値があったんだよ!Chai-1はね、タンパク質、低分子、DNA、RNAなど、幅広い分子の統合予測ができるんだ!
へぇ、それはすごいですね。でも博士、そんなに興奮して大丈夫ですか?また血圧が...
大丈夫だって!それよりもっとすごいのは、このモデルが商用利用可能なウェブインターフェースで無料公開されているんだよ!
無料で商用利用できるんですか?それは画期的ですね。でも博士、そろそろお茶でも飲んで落ち着いた方が...
お茶どころじゃないよ!Chai-1はね、PoseBustersベンチマークで77%の成功率を達成してるんだ。これはAlphaFold3の76%をわずかに上回ってるんだよ!
AlphaFold3を上回っているんですか?それはすごいです!でも博士、そろそろ深呼吸を...
深呼吸なんてしてる場合じゃない!CASP15タンパク質単量体構造予測では、Cα LDDTスコアが0.849を記録したんだ。これはESM3-98Bの0.801を大きく上回ってるんだよ!
博士、落ち着いてください。そもそもLDDTスコアって何ですか?
あ、そうだった。LDDTはLocal Distance Difference Testの略で、タンパク質構造予測の精度を評価する指標なんだ。1に近いほど精度が高いってことさ。
なるほど。でも博士、そろそろ座って...
座ってる場合じゃない!マルチマー構造予測でも、DockQ許容予測率が69.8%とAlphaFold-Multimerの67.7%を上回ってるんだ!
博士、マルチマー構造って何ですか?それに、そろそろ水でも...
水なんか飲んでる場合じゃない!マルチマー構造は複数のタンパク質サブユニットが結合した複合体の構造のことだよ。そしてね、Chai-1は多重配列アライメント(MSA)なしでも高性能なんだ!
MSAなしでも?それってどういう...博士、顔が真っ赤ですよ?
気にするな!MSAは複数の関連タンパク質配列を比較して並べたものだ。これまでのモデルはMSAを使って予測精度を上げてたんだけど、Chai-1はそれなしでも高い精度を出せるんだ!
すごいですね。でも博士、そろそろ休憩を...
休憩なんてしてる場合じゃない!Chai-1は単一配列からのマルチマー構造予測が可能なんだ!これは画期的なことなんだよ!
博士、落ち着いてください。深呼吸して...
深呼吸なんかしてる場合じゃ...あれ?なんか目が...
博士!しっかりしてください!
もう...博士ったら。こんなに興奮して...でも、Chai-1の話を聞いていると、私も少し興奮してきちゃいました。博士が目覚めたら、もっと詳しく教えてもらおうっと。その前に、お茶でも淹れておこうかな。
あれ?なんでお茶の箱にChai-1って書いてあるんだろう...まさか博士、興奮のあまりお茶の箱まで...
へへへ...Chai-1の話で、つい"茶"い(チャイ)が飲みたくなっちゃってね...
もう、博士ったら...
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